Imagej Binary Options




Imagej Binary OptionsO que fazem os diferentes comandos binarios Este submenu contem comandos que processam imagens binarias (preto e branco). Esses comandos assumem por padrao que os objetos sao pretos eo fundo e branco. Consulte este FAQ sobre como definir o padrao para o fundo preto e objetos brancos. Converte imagens em imagens a preto e branco. O nivel de limiar e determinado analisando o histograma da selecao atual ou de toda a imagem se nao houver selecao. Veja este FAQ descrevendo o algoritmo usado. Se a ferramenta ImagegtAdjustgtThreshold estiver ativa, sera exibida uma caixa de dialogo que permite especificar quais pixels estao definidos para a cor de plano de fundo e qual a cor de primeiro plano e se o plano de fundo e preto e o primeiro plano e branco. Por favor atualize o acima pode nao ser totalmente correto Com pilhas, todas as imagens na pilha sao convertidas para binario usando o limite calculado da fatia exibida atualmente. Use a macro ConvertStackToBinary para converter uma pilha em binario usando limiares calculados localmente. Converte imagens em imagens a preto e branco com base nas definicoes de limiar actuais. Por padrao, a mascara tera uma LUT inversora (o preto e 255 e o branco e 0), mas cria mascaras de fundo preto (0) se o fundo preto estiver marcado na caixa de dialogo ProcessgtBinarygtOptions. Por favor atualize, o acima pode nao ser totalmente correto Determina os maximos locais em uma imagem e cria uma imagem binaria (semelhante a mascara) do mesmo tamanho com os maximos, ou uma particula segmentada por maximo, marcado. Para imagens RGB, os maximos de luminancia sao selecionados, com a luminancia definida como media ponderada ou nao ponderada das cores, dependendo das configuracoes de EditgtOptionsgtConversions. Este comando e baseado em um plugin contribuido por Michael Schmid. Uma caixa de dialogo e exibida com as seguintes opcoes: Noise Tolerance - Maxima sao ignorados se nao se destacarem do ambiente por mais do que este valor (unidades calibradas para imagens calibradas). Por outras palavras, um limiar e fixado no valor maximo menos tolerancia ao ruido e a area contigua em torno do maximo acima do limiar e analisada. Para aceitar um maximo, esta area nao deve conter qualquer ponto com um valor maior do que o maximo. Apenas um maximo nesta area e aceito. Single Points - Cria uma imagem de saida com um unico ponto por maximo. Maxima Within Tolerance - Cria uma imagem de saida com todos os pontos dentro da Tolerancia de Ruido para cada maximo. Particulas segmentadas - Suponha que cada maximo pertence a uma particula e segmente a imagem por um algoritmo de bacias hidrograficas aplicado aos valores da imagem (em contraste com ProcessgtBinarygtWatershed, que usa o mapa de distancia Euclidiano). Selecao de ponto - Exibe uma selecao de varios pontos com um ponto em cada maximo nao produz nenhuma imagem de saida separada. Contagem - Exibe o numero de maximos na janela Resultados nao produz nenhuma imagem de saida. Excluir Edge Maxima - Exclui maxima se a area dentro da tolerancia de ruido em torno de um maximo toca a borda da imagem (borda da selecao nao importa). Luz de fundo - Permite o processamento de imagens que tem fundo claro e objetos escuros. Acima do Limiar Inferior - (Esta opcao so aparece para as imagens de limiar) Encontra os maximos acima do limiar inferior. O limite superior da imagem e ignorado. Se Particulas segmentadas for selecionado como Tipo de saida. A area abaixo do limiar mais baixo e considerada um fundo. Esta opcao so funciona quando se encontram maximos do valor de pixel no sentido matematico, isto e, fundo escuro e LUT nao inversa ou fundo brilhante e LUT inversora. Selecao de ponto de visualizacao - Mostra os maximos com os parametros atuais como uma selecao de varios pontos sobreposta na imagem. Se essa opcao estiver marcada, o numero de maximos encontrados tambem sera exibido na caixa de dialogo. Para tipos de saida Pontos Unicos. Maxima dentro da tolerancia e particulas segmentadas. Saida e uma imagem binaria, com primeiro plano 255 e fundo 0, usando um LUT invertido ou normal dependendo da opcao de fundo preto em ProcessgtBinarygtOptions. O numero de particulas (como obtido por analisar particulas) na imagem de saida nao depende do tipo de saida selecionado. Observe que Particulas segmentadas normalmente resultarao em particulas tocando a borda se Excluir limite maximo estiver selecionado. Excluir Edge Maxima aplica-se ao maximo, nao a particula. Encontre Maxima aplicado a uma imagem barulhenta com opcoes diferentes (Excluir Edge Maxima selecionado). Localizar Maxima nao funciona em pilhas, mas a macro FindStackMaxima executa-lo em todas as imagens em uma pilha e cria uma segunda pilha que contem as imagens de saida. Substitui cada pixel pelo valor minimo (mais leve) na vizinhanca 3times3. Com imagens binarias, remove os pixels das arestas de objetos pretos. Substitui cada pixel pelo valor maximo (mais escuro) na vizinhanca 3times3. Com imagens binarias, adiciona pixels as arestas de objetos pretos. Realiza uma operacao de erosao, seguida de dilatacao. Com imagens binarias, isso suaviza objetos e remove pixels isolados. Realiza uma operacao de dilatacao, seguida de erosao. Com imagens binarias, isso alisa objetos e enche em pequenos buracos. O comando tem um hifen de derivacao para diferencia-lo do arquivo fechado. Exibe uma caixa de dialogo que permite que varias configuracoes usadas pelos comandos no submenu Binario sejam alteradas. Iteracoes especifica o numero de vezes que a erosao, dilatacao, abertura e fechamento sao realizados. Count especifica o numero de pixels de plano de fundo adjacentes necessarios antes que um pixel seja removido da borda de um objeto durante a erosao eo numero de pixels de primeiro plano adjacentes necessarios antes de um pixel ser adicionado a borda de um objeto durante a dilatacao. Verifique o fundo preto se a imagem tem objetos brancos em um fundo preto. Se as arestas da almofada quando a erosao estiverem marcadas, ProcessgtBinarygtErode nao corroera das arestas da imagem. Esta definicao tambem afecta ProcessgtBinarygtClose. Que corroa a partir das arestas, a menos que esta caixa de selecao esteja selecionada. Saida EDM determina o tipo de saida para o ProcessgtBinarygtDistance Map. Ultimate Points e Voronoi comandos. Defina-o para substituir para saida de 8 bits que substitui a imagem de entrada de 8 bits. 16 bits ou 32 bits para imagens de saida separadas. A saida de 32 bits tem resolucao de distancia de ponto flutuante (subpixel). Gera um contorno de um pixel de objetos de primeiro plano (preto) em uma imagem binaria. A linha e desenhada dentro do objeto, isto e, nos pixels anteriores anteriores. Repetidamente remove pixels das bordas de objetos em uma imagem binaria ate que eles sao reduzidos para unico pixel wide skeletons. Os objetos sao assumidos como preto e branco de fundo. Observe que existem muitos algoritmos de esqueletizacao. Gera um mapa de distancia Euclidiano (EDM). Cada pixel de primeiro plano na imagem binaria e substituido por um valor de cinza igual a distancia desse pixel a partir do pixel de fundo mais proximo. Use ProcessgtBinarygtOptions para definir a cor de plano de fundo (preto ou branco) e o tipo de saida ao selecionar sobrescrever ou saida de 8 bits; observe que distancias maiores que 255 sao rotuladas como 255. Gera os pontos derrubados finais (UEPs) do EDM. Requer uma imagem binaria como entrada. As UEPs representam os centros de particulas que seriam separados por segmentacao. O valor de cinzento da UEP039 e igual ao raio do circulo inscrito da particula correspondente. Use ProcessgtBinarygtOptions para definir a cor de plano de fundo (preto ou branco) e o tipo de saida. A segmentacao do mapa de distancia Euclidiano (EDM) e uma maneira de separar ou separar automaticamente particulas que tocam (a separacao de uma imagem de escala de cinza esta disponivel atraves do comando Find Maxima). O comando Watershed requer uma imagem binaria contendo particulas pretas em um fundo branco. Primeiro calcula o mapa de distancia euclidiano e encontra os pontos erosionados finais (UEPs). Em seguida dilata cada uma das UEPs (os picos ou maximos locais do EDM) tanto quanto possivel - ate que a borda da particula seja atingida, ou o bordo da regiao de outra (crescente) UEP. A segmentacao de bacias hidrograficas funciona melhor para objetos convexos lisos que nao se sobrepoem demais. Aqui esta uma animacao que mostra como funciona a segmentacao de bacias hidrograficas. Divide a imagem por linhas de pontos com distancia igual as bordas das duas particulas mais proximas. Assim, a celula de Voronoi de cada particula inclui todos os pontos que estao mais proximos desta particula do que qualquer outra particula. Para o caso das particulas que sao pontos unicos, esta e uma tessellation de Voronoi (tambem conhecida como tessellation de Dirichlet). Na saida, o valor dentro das celulas Voronoi e zero, os valores de pixel das linhas divisorias entre as celulas sao iguais a distancia para as duas particulas mais proximas. Isto e semelhante a uma transformacao do eixo mediano do fundo, mas nao ha linhas nos furos internos das particulas. Escolha o tipo de saida (Overwrite, 8 bits, 16 bits ou 32 bits) ea cor de fundo (preto ou branco aplica-se tanto a entrada como a saida) na caixa de dialogo ProcessgtBinarygtOptions. Gui / process / binary. txt middot Ultima modificacao: 2010/01/26 11:07 (edicao externa)